Wiele lat upłynęło od wielkiej wojny shinobi. Dla Osady Ukrytej w Liściach nastała era pokoju. Boruto, syn Siódmego Hokage, prowadzi nudne i monotonne życie w cieniu wielkiego ojca. Jeszcze nie zdaje sobie sprawy, jak wielka katastrofa zbliża się ku osadzie... Oto początek legendy nowego pokolenia!