Każdego roku zagrożeniem na plantacjach marchwi, pietruszki, selera oraz buraka ćwikłowego są choroby i szkodniki, które, gdy nie są zwalczane, mogą spowodować istotne szkody. Podstawą skutecznej ochrony jest znajomość terminów występowania, stopnia zagrożenia, a głównie metod ich zwalczania. Do najważniejszych pod względem gospodarczym trzeba zaliczyć następujące choroby: alternarioza naci, mączniak prawdziwy, rizoktonioza, parch zwykły, szara pleśń, zgnilizna twardzikowa, mokra zgnilizna, plamistość zgorzelowa oraz zgnilizny kopcowe. Ze szkodników zaś trzeba wymienić mszyce, rolnice, guzaki, połyśnicę marchwiankę, mątwika burakowego i śmietkę ćwiklankę.