"Chciałabym być czarodziejką". Gdy pewnego dnia Madoka spotyka na swojej drodze Kyubeya i tajemniczą nową uczennicę ze swojej szkoły, Homurę Akemi, wie już, że w jej życiu zajdą ogromne zmiany. Wplątuje się w długą serię niezwykłych i niebezpiecznych zdarzeń i przy okazji dowiaduje się, jakie mroczne sekrety skrywa pozornie wspaniałe życie czarodziejek...