Jej pierwsza książka, "The Story of Owen: Dragon Slayer of Trondheim", została opublikowana w 2014 roku i rozgrywa się w alternatywnym współczesnym Ontario, gdzie występują smoki.
Była nominowana do nagrody Williama C. Morrisa w 2015 roku.
Jej kontynuacja, "Prairie Fire", ukazała się w 2015 roku.
Jej piąta powieść, Exit, Pursued By A Bear, została opublikowana w 2016 roku. Zainspirowana "Zimową Opowieścią" Szekspira, opowiada historię kapitana cheerleaderek Hermiony Winters, która odkrywa, że jest w ciąży po tym, jak została wykorzystana seksualnie na przyjęciu obozowym.
Została uznana za „Książkę Roku” przez kilka organizacji, w tym NPR, Publishers Weekly i New York Public Library. Zdobyła nagrodę Amy Mathers Teen Book Award przyznawaną przez Canadian Children's Book Centre w 2017 roku.
Johnston jako fanka Uniwersum Gwiezdnych Wojen, została poproszona o napisanie książki o postaci Ahsoce Tano.
Opublikowana w październiku 2016 r. powieść "Ahsoka" wypełnia lukę między swoimi występami w serialach "Wojny Klonów" i "Rebelianci".
Jej druga powieść "Star Wars: Queen's Shadow" (tytuł polski: "Star Wars: Cień Królowej"), została wydana w marcu 2019 roku. Fabuła "Cienia Królowej", gdzie występuje Padme Amidala, rozgrywa się w latach między wydarzeniami z "Mrocznego Widma" i "Ataku klonów".
Ponadto pani Johnston napisała także historię "By What Sun", skupiającą się na Miarze Larte, postaci stworzonej przez Johnstona w Ahsoce i osadzonej w wydarzeniach z "Nowej Nadziei".