Wieloplanowa akcja powieści "Znak wodny" w zasadzie rozgrywa się współcześnie, ale przeplatana jest licznymi dygresjami historycznymi, które mają na celu wykazanie ciągłości związku pokoleń, związanych z tym predyspozycji do określonego zawodu i ogólnego pokrewieństwa ludzi. Michał Glinka sygnalizuje również konieczność humanizacji życia w dzisiejszej epoce techniki, gdyż tylko w ten sposób można osiągnąć pełną radość tworzenia i tylko wówczas dzieło będzie godne tradycji dawnych mistrzów.